به منظور تربیت نیروی انسانی متخصص و متعهد در حوزه های قضایی ، آموزشی و علمی ، پس از تلاشهای بی وقفه شهید مظلوم آیت‌ا... دكتر بهشتی و شهید دكتر باهنر، دانشگاه قم در اواخر سال 1358 بر اساس تصویب شورای انقلاب اسلامی، زیر نظر جامعه مدرسین حوزه علمیه قم تحت عنوان «مدرسه عالی تربیتی و قضایی طلاب قم» تأسیس گردید و در سال 1359 رسماً اقدام به پذیرش دانشجو در دو رشته كارشناسی علوم قضایی و دبیری الهیات از بین طلاب دوره سطح حوزه علمیه نمود. در سال 1364 با تأیید شورایعالی انقلاب فرهنگی علاوه بر طلاب حوزه‌های علمیه، فارغ‌التحصیلان دروه‌های متوسطه نظام قدیم نیز از طریق كنكور سراسری پذیرفته شدند. در ادامه فعالیتهای آموزشی در سال 1367طی مصوبه ای، مركز تربیت مدرس دانشگاه قم با هدف تربیت اساتید شایسته و كارآمد برای تدریس معارف اسلامی در دانشگاهها، آغاز به كار نمود. در تاریخ 31/3/1376 با تصویب شورای گسترش آموزش عالی مدرسه عالی تربیتی و قضایی طلاب به «دانشگاه قم» تغییر وضعیت داد و این مجموعه با 6 رشته در مقطع كارشناسی، 5 رشته در مقطع كارشناسی ارشد و یك رشته در مقطع دكتری تخصصی فعالیت خود را ادامه داد و اساسنامه جدید دانشگاه قم در جلسه مورخ 25/10/1378 شورای گسترش آموزش عالی، به تصویب نهایی رسید.و از آن پس دانشگاه قم در چارچوب مقررات وزارت علوم به فعالیت خود ادامه داد.در مدت زمان كوتاهی تعداد رشته‌های دانشگاه قم رشد چشمگیری داشت. بطوریكه از 12 رشته در سال 1376 به 30 رشته در سال 1380 رسیده است، كه از این تعداد 18 رشته در مقطع كارشناسی ، 7 رشته در مقطع كارشناسی ارشد و 5 رشته در مقطع دكتری، بوده است. هم‌ اكنون دانشگاه قم دارای 7 دانشكده و مركزآموزشی، 3 مركز پژوهشی و فناوری، 34 گروه آموزشی و پژوهشی و 77 رشته تحصیلی در مقاطع كارشناسی ناپیوسته، كارشناسی، كارشناسی ارشد و دكتری تخصصی می باشد.