آیت اللّه آشتیانی آثار متعددی در فقه و اصول و فلسفه و حكمت و عرفان از خود به یادگار گذاشته است كه بسیاری از آنها هنوز به چاپ نرسیده است. لذا مناسب است اهل فن به این مهم اقدام ورزند و آثار با ارزش آن حكیم فرزانه را كه از ذخائر با ارزش معارف اسلامی است احیاء كنند.
تألیفات ایشان به این شرح است:
1 - حاشیه بر مكاسب شیخ انصاری (ره)
2 - حاشیه بر كفایة الاصول
3 - حاشیه بر فرائد الاصول
4 - تعليقه بر حكمت منظومه سبزوارى، طهران، 1352.
5 - تعلیقه بر منطق منظومه سبزواری [1]
6 - تعلیقه بر اسفار اربعه
7 - تعلیقه بر اشارات بوعلی
8 - تعلیقه بر فصوص فارابی
9 - تعلیقه بر شفاء بوعلی
10 - تعلیقه بر فصوص ابن عربی
11 - تعلیقه بر مصباح الانس
12 - اساس التوحید [2]
13 - رسالهای در علم اجمالی و طلب و اراده
14 - رساله در اثبات معراج جسمانی
15 - رسالهای در اثبات معاد جسمانی
16 - رسالهای در شق القمر
17 - شرح حدیث عمران صابی
18 - شرح بر مشكلات حافظ
19 - ترجمهای بر اشارات بوعلی
20 - ترجمه اسفار اربعه
21 - رسالهای در حقیقت كتاب و میزان به مذاق عرفا، ط تهران، 1352
23 - رسالهای در جبر و تفویض
[1] - سید جلال الدین آشتیانی نوشتهاند: «تعلیقات آن بزرگوار، بهترین تعلیقه بر شرح منظومه است.»( اساس التوحید، ص 1، مقدمه سيد جلال الدين آشتيانى.)
[2] -، ط تهران، دانشگاه تهران. این كتاب كه قبلاً با مقدمه آقای منوچهر صدوقی سُها چاپ شده بود اخیراً با مقدمه و تصحیح آیتاللّه سید جلال الدین آشتیانی مجدداً به چاپ رسیده است.