این پژوهشكده دارای پنج گروه علمی با عنوانهای: «تاریخ و تمدن»، «غرب‌شناسی»، «مطالعات انقلاب اسلامی» و «ادبیات اندیشه» «فرهنگ پژوهی» است.
اهداف و برنامه‌های كلی پژوهشكده
شناخت و بازپیرایی مواریث مكتوب علمی اسلامی در حوزه تاریخ، تمدن، فرهنگ و هنر ایران و اسلام،
تحقیق در زمینه كاستیهای دیرین و آسیب‌شناسی وضعیت كنونی و بررسی چشم‌انداز و چالش‌های آتی فرهنگ و تمدن اسلامی و ارائه راهكارهای شایسته جهت احیاء و ارتقای فرهنگ و هنر اسلامی ایرانی و تعمیق پیوند نسل امروز با آن، بررسی و تبیین نظری پیشینه، مبانی، اهداف و فرآیند تحقق انقلاب اسلامی و مطالعه و بازشناسی مسائل و موانع انقلاب و راههای تحكیم اصول و توسعه آرمانها و ارزشهای متعالی آن، و مصون‌سازی طبقات اجتماعی در قبال تازش فكری ـ فرهنگی بیگانگان،
بازشناسی ماهیت و مؤلفه‌های فكر و فرهنگ غربی و نقد و ارزیابی علمی دستاوردهای تمدن جدید، و بررسی راههای توسعه اندیشه اسلامی و طرق اصطیاد عناصر انسانی و عقلانی و تمدن دیگر ملل،
نقد آثار منتشر و آراء مطرح شده در حوزه‌های مطالعاتی پژوهشكده.