پژوهشكده لیزر در سال 1372 در دانشكده علوم فعالیت خود را آغاز نمود. در سال 74 این پژوهشكده مجوز اصولی و در سال 1377 مجوز قطعی تأسیس خود را از شورای گسترش وزارت علوم، تحقیقات و فناوری دریافت نمود و در سال 1383 به دنبال گسترش فعالیتها، به پژوهشكده لیزر و پلاسما تغییر نام یافت.

اولین دوره كارشناسی ارشد فوتونیك در سال 81 در پژوهشكده راه اندازی شد. دوره دكتری فوتونیك در سال 1383 و كارشناسی ارشد مهندسی پلاسما نیز در سال 1384 شروع به فعالیت و جذب دانشجو نمودند. آمار دانشجویان 

این دوره ها به منظور فعالیت حرفه ای و دقیق علمی در موضوعات مرتبط ایجاد شده اند و فارغ التحصیلان غالبا" به ادامه تحصیل پرداخته و یا در مجموعه های مختلف تخصصی مرتبط مشغول به كار شده اند.

هدف اصلی این پژوهشكده گسترش علم لیزر، اپتیك، فوتونیك و پلاسما با تربیت نیروی متخصص، انجام تحقیقات پایه ای جهت گسترش مرزهای علم و تحقیقات كاربردی در صنعت و علوم، می باشد.

در حال حاضر 5 گروه پژوهشی مصوب زیر در پژوهشكده لیزر و پلاسما وجود دارد:

1- كاربردهای لیزر

2- تكنولوژی لیزر

3- ماده چگال

4- بیوفوتونیك

5- مهندسی پلاسما

همچنین این پژوهشكده شامل 18 آزمایشگاه فعال می باشد.

1.     آزمایشگاه ادوات فعال نوری  

2.     آزمایشگاه پلاسما  

3.     آزمایشگاه طیف سنجی لیزری  

4.     آزمایشگاه فوتونیك مواد آلی و پلیمرها  

5.     آزمایشگاه لیزرهای گازی  

6.     آزمایشگاه مگنتو فوتونیك  

7.     آزمایشگاه نانو مغناطیس و نیمرساناهای مغناطیسی  

8.     گروه بیوفوتونیك  

8.

هم اكنون تعداد 16 عضو هیأت علمی در پژوهشكده فعالیت دارند.