این مدیریت مسئولیت برگزاری دوره‌های كارشناسی ارشد و دكتری در 14 رشته مصوب را بر عهده دارد. واحدهای پایان‌نامه‌ها، خدمات آموزشی و امتحانات، سه واحد تشكیل‌دهنده این مدیریت می باشند. صدور احكام استادان راهنما و مشاور، و انجام امور مربوط به مراحل مختلف پایان‌نامه‌ها از وظایف واحد پایان‌نامه‌ها می‌باشد. واحد امتحانات و خدمات آموزشی نیز غیر از وظایفی كه در مدیریت امور آموزشی بر عهده آن‌ها است، مسؤولیت پذیرش و آزمون‌های دكتری نیز از جمله وظایف آن‌ها می‌باشد.